Instalar plugins no seu servidor é bem fácil, você precisa primeiramente mudar o seu servidor para o Paper, para fazer isto é só ir em configurações > versões no seu painel, e clicar em confirmar na versão do paper desejada:

Depois de confirmar você pode abrir o servidor novamente, será gerada uma pasta plugins no gerenciador de arquivos onde você pode enviar o .jar dos plugins que você quiser:
​
​
Ainda com dúvidas? Chama a gente no chat