Para instalar o Fabric no seu servidor é bem simples!

Você somente precisa ir em versões no seu painel e no final da página selecionar o Fabric, e iniciar o servidor, após iniciar o servidor você deve digitar no console a versão do jogo desejada que o painel irá instalar a versão mais recente do modloader!

Caso ocorra algum erro exclua a sua pasta libraries no gerenciador de arquivos!

Passo-a-passo:

Selecione a versão no final de versões no seu painel clicando em confirmar:

Após isto volte para a aba console e inicie o servidor, assim que o console lhe perguntar a versão digite ela onde eu indico na imagem, e dê enter!